Биоинформатические услуги и анализ данных

RNA-seq
  • Контроль качества сырых данных, очистка от мусора.
  • Выравнивание по референсу (или де-ново). (Статистика выравнивания)
  • Количественный анализ TPM/RPKM/FPKM
  • Анализ дифференциальной экспресси
  • Функциональный анализ (enrichment analysis):
  • Gene Onthology/Oncology onthology
  • Собственная онтология патогенетических процессов связанных с развитием опухоли
  • Анализ сигнальных сетей
  • Выявление фьюжн-генов
  • Финальный развернутый отчет, где:
  • Показаны гены, значимо изменившие уровень экспрессии
  • Визуализация данных
  • Индивидуальные запросы
Биоинформатические услуги:
  • Обработка и анализ клинических экзомов Обработка и анализ результатов NGS
  • Статистический анализ
  • WGS/WES (whole genome/exome sequencing)
  • Соматические мутации (SNV, CNV, InDel)
Анализ и визуализация данных
  • Функциональный анализ
  • Статистическая обработка данных
  • Визуализация данных
  • Создание web-сервисов по определенным критериям